在《X战警：黑凤凰》中，故事主线围绕琴·葛蕾展开，她是X战警中最具天赋却也最不稳定的成员。当团队执行一次高风险的太空营救任务时，琴意外被一股神秘的宇宙能量吞噬，这股力量极大增强了她的变种能力，却也悄然腐蚀着她的心智。

随着力量失控，琴逐渐转变为亦正亦邪的“黑凤凰”，其破坏力足以威胁全球。X教授与万磁王再度因理念冲突而对立，整个变种人世界陷入分裂。影片深入探讨了力量、身份与救赎的主题，展现了琴在光明与黑暗之间的痛苦挣扎，以及X战警为拯救家人与世界所做的最终努力。