《神盾局特工》第一季作为漫威电影宇宙的衍生剧集，在《复仇者联盟》纽约大战的余波中展开。世界因外星入侵而改变，超自然现象与超能威胁层出不穷。此时，一度被认为在纽约之战中牺牲的特工菲尔·科尔森神秘“复活”，并奉命招募了一支个性鲜明、技能各异的特工精英，组建起一支直接应对奇异威胁的特别行动小队。

这支小队包括格斗专家格兰特·沃德、天才科学家里奥·菲茨和珍玛·西蒙斯，以及平民黑客斯凯。他们驾驶着集尖端科技于一身的“巴士”空中指挥中心，在全球范围内处理各种超常规事件——从调查084未知物品，到应对层出不穷的异人族威胁，每一步都游走在危险边缘。

剧集不仅延续了漫威宏大的世界观，更深挖了神盾局这个庞大组织的内部运作与暗流涌动。随着剧情推进，小队成员们不仅要对抗外部的敌对势力，更要面对来自神盾局内部的信任危机与惊人背叛。他们的每一次任务都在试图拼凑出一个更大的谜团，而这个谜团的答案，将直指神盾局乃至整个世界的存亡根基。