《16岁症候群》聚焦于青春期身份认同与心理创伤的碰撞。主角东息吹（竹内爱纱 饰）以中性魅力成为校园焦点，而她的青梅竹马织田泽芽衣（武田玲奈 饰）却深陷男性恐惧症的阴影——这源于小学时的一场诱拐事件。息吹因此立誓守护芽衣，两人形成了外人难以介入的独特羁绊。

然而，一个神秘男子的突然出现，打破了她们微妙的平衡。他看似无意地接近芽衣，却似乎对当年的事件了如指掌。息吹在保护芽衣的过程中，不得不直面自己隐藏的情感与身份困惑。随着真相层层剥开，两人之间的信任与依赖也面临前所未有的考验。

本剧以细腻的笔触描绘了少女成长中的脆弱与坚韧，探讨了“保护”与“被保护”关系的复杂性。当16岁的症候群逐渐显现，她们能否跨越心理障碍，找到真正的自我与彼此间的答案？